使用Prism 7分析、圖解、展示科學(xué)數(shù)據(jù),體驗前所未有的神速

概述
GraphPad Prism可用于Windows和Mac計算機,結(jié)合了科學(xué)繪圖、綜合曲線擬合(非線性回歸),讓您可理解的統(tǒng)計和數(shù)據(jù)組織。
GraphPad Prism最初是為醫(yī)學(xué)院校和藥物公司的實驗生物學(xué)家設(shè)計的,特別是在藥理學(xué)和生理學(xué)方面。如今,各種生物學(xué)家以及社會和物理學(xué)家已廣泛使用Prism。超過110個國家的20多萬科學(xué)家依靠Prism來分析、圖解和展示科學(xué)數(shù)據(jù)。本科生和研究生廣泛使用Prism。
非線性回歸:
非線性回歸是分析數(shù)據(jù)的重要工具,但通常比它需要的更困難。沒有其他程序能把曲線擬合簡化得和Prism一樣。事實上,您通??梢栽谝粋€步驟中擬合曲線。只需從廣泛使用的方程式列表中選擇一個方程式(或輸入您自己的方程式),Prism將自動適應(yīng)該曲線,將結(jié)果顯示為表格,在圖表上繪制曲線,并插入未知值。
將多個數(shù)據(jù)集的數(shù)據(jù)并排放在一個有組織的數(shù)據(jù)表上,Prism可以一次性適應(yīng)所有數(shù)據(jù)集。您可以將相同的模型分別應(yīng)用到每個數(shù)據(jù)集,使用全局非線性回歸在數(shù)據(jù)集之間共享參數(shù)值,或者將不同的模型適用于不同的數(shù)據(jù)集。
Prism還為您提供了許多高級配件選項。它可以將最佳擬合參數(shù)的置信區(qū)間報告為不對稱范圍(輪廓似然法),其比通常的對稱間隔準(zhǔn)確得多。它還可以自動內(nèi)插來自標(biāo)準(zhǔn)曲線的未知值(即分析RIA數(shù)據(jù)),使用F測試或Akaike的信息準(zhǔn)則(AIC)比較兩個方程的擬合、圖殘差、識別異常值、差分重量數(shù)據(jù)點、正態(tài)性的測試殘差,等等。
可理解的統(tǒng)計
雖然它不會取代重型統(tǒng)計程序,Prism允許您輕松地執(zhí)行實驗室和臨床研究人員通常使用的基本統(tǒng)計測試。Prism提供t檢驗、非參數(shù)比較、一,二和三因素方差分析、應(yīng)急表分析和生存分析。分析選擇以清晰的語言表示,避免不必要的統(tǒng)計術(shù)語。


與其他程序不同,Prism在需要時提供易于理解的統(tǒng)計幫助。任何數(shù)據(jù)分析對話框均可點“Learn”,Prism的在線文檔將為您解釋分析的原理,這可幫助您做出適當(dāng)?shù)倪x擇。一旦您做出選擇,Prism就會在組織有序且易于跟蹤的表格上呈現(xiàn)出結(jié)果。Prism文檔囊括的內(nèi)容超出了您的預(yù)期。其中一半以上用于徹底解釋基本統(tǒng)計和非線性曲線擬合,教您如何正確分析數(shù)據(jù)所需的知識。
分析檢查表
一旦您完成了分析,Prism的獨特的分析檢查清單幫助您確保選擇的分析符合實驗設(shè)計,并且確保您了解分析背后的假設(shè)。

回溯每個分析
除非您能夠準(zhǔn)確地記錄數(shù)據(jù)如何分析,否則就不是真正的科學(xué)。在Prism這不是一個問題。您永遠不會想知道結(jié)果是如何實現(xiàn)的。即使工作是由其他人完成的,您也可以查看(和更改)所有分析選擇,并查看分析的順序(即在曲線擬合之前X值被轉(zhuǎn)換為對數(shù))。同樣,您可以輕松檢查誤差棒是否代表SD或SEM(或其他)。

自動化,無需編程
Prism項目的所有部分都已鏈接。這意味著,當(dāng)您修復(fù)數(shù)據(jù)輸入錯誤時,Prism自動更新所有結(jié)果、圖形和布局。另一個優(yōu)點是,您可以立即分析重復(fù)實驗。在您使用一個實驗的數(shù)據(jù)完成分析和繪圖步驟后,您不必重復(fù)所有這些步驟。Prism提供了幾種方法來回收您的工作 - 即時分析和繪制重復(fù)實驗,而不需要重復(fù)任何冗長的步驟,也不需要任何腳本或編程。 Prism還為那些想要更復(fù)雜自動化的人提供了一種腳本語言。
自動錯誤條

如果輸入原始數(shù)據(jù),Prism可以自動將誤差條繪制為SD、SEM、范圍、四分位數(shù)范圍或95%置信區(qū)間。
如果您在其他地方計算錯誤值,請將其輸入到帶標(biāo)簽(SD或SEM)子列中。Prism的分析(即t檢驗、ANOVA、回歸)將考慮SD(或SEM)和樣本大小。
工作的完整記錄
Prism項目文件可以包含多個數(shù)據(jù)、分析和圖形。Prism文件可以是您的實驗的完整記錄。每個文件可以包含任意數(shù)量的數(shù)據(jù)表、信息頁、分析結(jié)果、圖形和頁面布局。
數(shù)據(jù)表不僅可以包含您分析的數(shù)據(jù)和圖形,還可以包含您決定排除的數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)仍保留在數(shù)據(jù)表中(以藍色斜體顯示)。您可以將以后會查看的值突出顯示。
每個信息頁可以存儲非結(jié)構(gòu)化注釋和結(jié)構(gòu)化信息常量,例如批號、集中度、筆記本頁碼等。
圖形和布局可以用文本、線條、箭頭、框、表、方程、圖片等進行裝飾。
使用帶有顏色標(biāo)記的浮動注釋注釋任何頁面,并突出顯示(以您選擇的顏色)要再次查看的網(wǎng)頁的名稱,或希望其他人審核。
將Prism文件保存在計算機或網(wǎng)絡(luò)上,或直接保存到LabArchives,一個基于云的實驗室筆記本。
準(zhǔn)備好發(fā)布
Prism將您從原始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為可用于演示文稿、海報或出版物的圖形(或布局)。單擊即可將完成的圖形或布局發(fā)送到PowerPoint或Word。 當(dāng)然,也復(fù)制和粘貼工作。導(dǎo)出到TIFF、EPS、JPG、PDF(以及更多其他格式),以及滿足科學(xué)期刊要求所需的所有選項。
Prism 7有哪些新功能?
Prism 7允許您進行更多種類的統(tǒng)計分析,制作更多種類的圖形,并更靈活地組織數(shù)據(jù)。
以下是一些亮點:
熱圖

三向ANOVA

FDR方法進行多重比較

來自非線性回歸的更準(zhǔn)確(不對稱,相似性)置信區(qū)間

子欄標(biāo)簽

工作薄名稱的彩色編碼,以及表格的選中單元格

半透明的顏色,讓您可以看到重疊

將日期(或已用時間)輸入為X值

統(tǒng)計比較
•配對或非配對t檢驗。報告P值和置信區(qū)間。
•非參數(shù)Mann-Whitney檢驗,包括中位數(shù)差異的置信區(qū)間。
•Kolmogorov-Smirnov檢驗比較兩組。
•置信區(qū)間為中位數(shù)的Wilcoxon檢驗。
•使用錯誤發(fā)現(xiàn)率(或Bonferroni多重比較)同時執(zhí)行許多t檢驗,以選擇哪些比較是進一步研究的發(fā)現(xiàn)。
•普通或重復(fù)測量單因素方差分析,然后是Tukey、Newman-Keuls、Dunnett、Bonferroni或Holm-Sidak多重比較檢驗,趨勢后檢驗或Fisher最小顯著性檢驗。
•許多多重比較測試伴隨有置信區(qū)間和多重調(diào)整的P值。
•Greenhouse-Geisser校正,因此重復(fù)測量單因素方差分析不必假設(shè)球形。當(dāng)選擇這個時,多個比較測試也不假定球形。
•Kruskal-Wallis或Friedman非參數(shù)單因素方差分析與Dunn的后檢驗。
•Fisher精確檢驗或卡方檢驗。用置信區(qū)間計算相對危險度和優(yōu)勢比。
•雙向方差分析,即使有一些后期測試的缺失值。
•雙因素方差分析,在一個或兩個因素中重復(fù)測量。Tukey、Newman-Keuls、Dunnett、Bonferron、Holm-Sidak或Fishers LSD多重比較測試主要和簡單的效果。
•三因素方差分析(限于兩個因素中的兩個水平,第三個水平中的任意數(shù)量水平)。
•Kaplan-Meier生存分析。將比較曲線與對數(shù)秩檢驗(包括趨勢檢驗)。
列統(tǒng)計
•計算最小、最大、四分位數(shù)、平均值、SD、SEM、CI、CV,
•平均或幾何平均值與置信區(qū)間。
•頻率分布(bin到直方圖),包括累積直方圖。
•通過三種方法進行正常性測試。
•一個樣品t檢驗或Wilcoxon檢驗,以將柱平均值(或中值)與理論值進行比較。
•偏度和峰度。
•使用Grubbs或ROUT方法識別異常值。
線性回歸和相關(guān)
•以置信區(qū)間計算斜率和截距。
•強制回歸線通過指定點。
•適合重復(fù)Y值或平均值Y.
•使用運行測試測試線性度的偏差。
•計算和圖形殘差。
•比較兩條或更多回歸線的斜率和截距。
•沿標(biāo)準(zhǔn)曲線插入新點。
•Pearson或Spearman(非參數(shù))相關(guān)。
•使用Bonferroni多重比較或FDR方法分析一疊P值,以確定“重要”發(fā)現(xiàn)或發(fā)現(xiàn)。
非線性回歸
•選擇我們的105個內(nèi)置方程式的任意一個或輸入您自己的方程式。
•輸入微分或隱式方程。
•為不同的數(shù)據(jù)集輸入不同的方程。
•全局的非線性回歸 - 共享數(shù)據(jù)集之間的參數(shù)。
•穩(wěn)健的非線性回歸。
•自動異常值識別或消除。
•使用額外的平方和F檢驗或AICc比較模型。
•比較數(shù)據(jù)集之間的參數(shù)。
•應(yīng)用約束。
•通過幾種方法對差異點進行加權(quán)、并評估加權(quán)方法的效果。
•采用自動初始估計值或輸入您自己的值。
•在X值的指定范圍內(nèi)自動繪制曲線。
•量化參數(shù)的SE或CI擬合的精度。置信區(qū)間可以是對稱的(如傳統(tǒng)的)或不對稱的(這是更準(zhǔn)確的)。
•使用Hougaard的偏度來量化不精確性的對稱性。
•繪制置信度或預(yù)測帶。
•測試殘差的正態(tài)性。
•運行或復(fù)制模型充分性的測試。
•報告協(xié)方差矩陣或依賴關(guān)系集。
•從最佳擬合曲線中輕松插入點。
臨床(診斷)實驗室統(tǒng)計
•Bland-Altman圖。
•接收器操作特性(ROC)曲線。
•Deming回歸(II型線性回歸)。
模擬
•模擬XY,列或應(yīng)急表。
•重復(fù)分析模擬數(shù)據(jù)作為蒙特卡羅分析。
•從您選擇或輸入的方程式和選擇的參數(shù)值繪制函數(shù)。
其他計算
•帶置信區(qū)間的曲線下面積。
•轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)。
•規(guī)范化。
•識別異常值。
•正態(tài)性測試。
•轉(zhuǎn)置表。
•減去基線(和組合列)。
•將每個值計算為其行,列或總計的一小部分。
系統(tǒng)要求
•用于Windows的Prism 7在32位或64位版本的Windows Vista,7,8或10下運行.Prism將運行在小到800 x 540的屏幕上。雖然在64位版本的Windows上運行良好,它是一個32位程序。
•Prism 7 for Macintosh需要OS X 10.9(Mavericks)或更高版本。
•Prism在硬盤驅(qū)動器上需要90兆字節(jié)的空間。
GraphPad Prism官網(wǎng): http://www.graphpad-prism.cn/
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